ХАРАКТЕРИСТИКА СОМАТИЧЕСКИХ МУТАЦИЙ В ГЕНЕ KRAS У ПАЦИЕНТОВ С КОЛОРЕКТАЛЬНОЙ АДЕНОКАРЦИНОМОЙ
Введение. Анализ мутационного статуса онкогена KRAS используется в качестве биомаркера прогностической эффективности таргетного лечения колоректального рака (КРР). Клинические испытания показали, что только ген дикого типа KRAS позволяет проводить эффективную таргетную терапию, нацеленную на рецептор эпидермального фактора роста (EGFR). Тестирование мутаций в этом гене создает надежные ориентиры в виде частот и типов KRAS-мутаций в различных клинических группах пациентов.
Изучение частоты мутаций в гене KRAS и их связь с клинико-патологическими особенностями у пациентов различных гендерных и возрастных групп с колоректальным раком на Юге России ранее не проводились. Вместе с тем гендерные группы пациентов могут иметь свои особенности с точки зрения различий в частотах проявления соматических мутаций в гене KRAS. Поэтому цель настоящего исследования заключалась в изучении полиморфизма семи SNP-мутаций соматического происхождения в гене KRAS опухолевых биоптатов пациентов различных гендерных и возрастных групп с диагнозом КРР Юга России для прогнозирования потенциальных групп риска пациентов.
Материал и методы. В исследовании участвовали 800 пациентов Юга России и Северного Кавказа: 374 пациента мужского пола и 426 – женского в возрасте от 28 до 89 лет с морфологически подтвержденным диагнозом «аденокарцинома толстой кишки». Для молекулярно-генетического исследования использовали 3 мкм FFPE срезы, содержащие не менее 20% опухолевых клеток. Экстракция ДНК включала стандартную процедуру депарафинирования в ортоксилоле, лизис в 2% SDS-буфере в присутствии протеиназы K и очистку на колонках QIAamp® DNA FFPE Tissue Kit (QIAGENE, Германия). Для проведения RTPCR концентрацию ДНК нормализовывали до величины 2 нг/мкл. При помощи набора реагентов RealTime-PCR-KRAS-7M («Биолинк», Россия) проводили определение семи миссенс-мутаций в 12-м и 13-м кодонах гена KRAS: G12C, G12S, G12R, G12V, G12D, G12A, G13D.
Результаты. Как показали результаты нашего исследования, в объединенной группе пациентов мужского и женского пола частота проявления соматических мутаций в гене KRAS была больше в группе старше 55 лет (41%) по сравнению с группой пациентов моложе 55 лет (34%) для уровня значимости p < 0,05.
Подобного рода закономерность не была выявлена среди пациентов мужского пола, у которых частота проявления соматических мутаций в гене KRAS составила в группе старше 55 лет 35%, в группе пациентов моложе 55 лет – 32,4%. Среди пациентов женского пола частота проявления соматических мутаций в гене KRAS составила в группе старше 55 лет 35%, в группе пациентов моложе 55 лет – 47,1%. Эти различия статистически достоверны для уровня значимости p < 0,05.
Выводы. Частота проявления соматических мутаций во 2-м кодоне гена KRAS различается у пациентов различных возрастных гендерных и возрастных групп пациентов Юга России. Частота проявления соматических мутаций во 2-м кодоне гена KRAS выше у пациентов женского пола. Среди пациенток женского пола частота проявления соматических мутаций во 2-м кодоне гена KRAS выше в возрастной группе старше 55 лет по сравнению с возрастной группой моложе 55 лет. Этот вывод позволяет предположить значимость изменения гормонального фона у пациенток пре- и постменопаузальных групп в возникновении соматических мутаций в гене KRAS.
Кит О.И., Водолажский Д.И., Енин Я.С., Олейников Д.Д., Кожушко М.А.,
Владимирова Л.Ю.
Введение. Анализ мутационного статуса онкогена KRAS используется в качестве биомаркера прогностической эффективности таргетного лечения колоректального рака (КРР). Клинические испытания показали, что только ген дикого типа KRAS позволяет проводить эффективную таргетную терапию, нацеленную на рецептор эпидермального фактора роста (EGFR). Тестирование мутаций в этом гене создает надежные ориентиры в виде частот и типов KRAS-мутаций в различных клинических группах пациентов.
Изучение частоты мутаций в гене KRAS и их связь с клинико-патологическими особенностями у пациентов различных гендерных и возрастных групп с колоректальным раком на Юге России ранее не проводились. Вместе с тем гендерные группы пациентов могут иметь свои особенности с точки зрения различий в частотах проявления соматических мутаций в гене KRAS. Поэтому цель настоящего исследования заключалась в изучении полиморфизма семи SNP-мутаций соматического происхождения в гене KRAS опухолевых биоптатов пациентов различных гендерных и возрастных групп с диагнозом КРР Юга России для прогнозирования потенциальных групп риска пациентов.
Материал и методы. В исследовании участвовали 800 пациентов Юга России и Северного Кавказа: 374 пациента мужского пола и 426 – женского в возрасте от 28 до 89 лет с морфологически подтвержденным диагнозом «аденокарцинома толстой кишки». Для молекулярно-генетического исследования использовали 3 мкм FFPE срезы, содержащие не менее 20% опухолевых клеток. Экстракция ДНК включала стандартную процедуру депарафинирования в ортоксилоле, лизис в 2% SDS-буфере в присутствии протеиназы K и очистку на колонках QIAamp® DNA FFPE Tissue Kit (QIAGENE, Германия). Для проведения RTPCR концентрацию ДНК нормализовывали до величины 2 нг/мкл. При помощи набора реагентов RealTime-PCR-KRAS-7M («Биолинк», Россия) проводили определение семи миссенс-мутаций в 12-м и 13-м кодонах гена KRAS: G12C, G12S, G12R, G12V, G12D, G12A, G13D.
Результаты. Как показали результаты нашего исследования, в объединенной группе пациентов мужского и женского пола частота проявления соматических мутаций в гене KRAS была больше в группе старше 55 лет (41%) по сравнению с группой пациентов моложе 55 лет (34%) для уровня значимости p < 0,05.
Подобного рода закономерность не была выявлена среди пациентов мужского пола, у которых частота проявления соматических мутаций в гене KRAS составила в группе старше 55 лет 35%, в группе пациентов моложе 55 лет – 32,4%. Среди пациентов женского пола частота проявления соматических мутаций в гене KRAS составила в группе старше 55 лет 35%, в группе пациентов моложе 55 лет – 47,1%. Эти различия статистически достоверны для уровня значимости p < 0,05.
Выводы. Частота проявления соматических мутаций во 2-м кодоне гена KRAS различается у пациентов различных возрастных гендерных и возрастных групп пациентов Юга России. Частота проявления соматических мутаций во 2-м кодоне гена KRAS выше у пациентов женского пола. Среди пациенток женского пола частота проявления соматических мутаций во 2-м кодоне гена KRAS выше в возрастной группе старше 55 лет по сравнению с возрастной группой моложе 55 лет. Этот вывод позволяет предположить значимость изменения гормонального фона у пациенток пре- и постменопаузальных групп в возникновении соматических мутаций в гене KRAS.
Кит О.И., Водолажский Д.И., Енин Я.С., Олейников Д.Д., Кожушко М.А.,
Владимирова Л.Ю.