АБЕРРАНТНОЕ МЕТИЛИРОВАНИЕ УЧАСТКОВ ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ APC, CDH13 ПРИ МЕТАСТАЗИРУЮЩЕМ РАКЕ ТОЛСТОЙ КИШКИ
Введение. Аберрантное метилирование генов – частое эпигенетическое событие в спорадических опухолях толстой кишки (CRC), по разным оценкам, составляет 15–80%. Транскрипционная активность вовлеченных в канцерогенез генов APC, CDH13, MLH1, MGMT, P16 и RASSF1A также подавляется в опухолях человека посредством метилирования их регуляторных областей, что может быть использовано для диагностики и определения прогноза развития рака.
Материал и методы. С помощью метода бисульфитного пиросеквенирования был определен уровень метилирования (Met, %) 65 CpG-сайтов промоторных участков шести генов (APC, CDH13, MLH1, MGMT, P16 и RASSF1A) в опухолях и условно нормальных тканях толстой кишки. В исследование вошли 50 пациентов (по 25 мужчин и женщин, медиана возраста – 60,5 лет), прооперированных в Ростовском научно-исследовательском онкологическом институте. Выборку гистологически подтвержденного CRC составили аденокарциномы G2–G3, из которых 15 опухолей классифицировали как T3N0M0, 35 случаев с метастазами различной локализации – T3-4N1-2M0-1.
Результаты. В образцах опухолей отмечено статистически достоверное повышение уровня метилирования промоторных участков APC, CDH13, MGMT, P16 и RASSF1A (в 3–5 раз при p < 0,01) в 36, 53, 38, 25 и 8% случаев соответственно. В целом, 35 образцов колоректальных неоплазий (70%) продемонстрировали CpG-гиперметилирование хотя бы по одному гену, 16 из них (45%) были гиперметилированы по трем-четырем генам. Определение ассоциаций возраста и пола пациентов с уровнем метилирования CpG-сайтов не выявил значимой корреляции, за исключением метилирования гена MGMT, уровень которого изменялся обратно пропорционально возрасту. Выявлена ассоциация статуса метилирования APC, CDH13, MGMT, P16 и RASSF1A с формированием метастазов (χ2 = 7,3, р = 0,007). В данном исследовании идентифицировано только два случая CpG-гиперметилирования (медиана Met = 42%) промотора MLH1.
Выводы. Полученные данные об увеличении метилирования промоторных участков пяти геновонкосупрессоров могут быть использованы в качестве чувствительных предиктивных маркеров прогрессии и метастазирования колоректального рака.
Водолажский Д.И., Тимошкина Н.Н.
Введение. Аберрантное метилирование генов – частое эпигенетическое событие в спорадических опухолях толстой кишки (CRC), по разным оценкам, составляет 15–80%. Транскрипционная активность вовлеченных в канцерогенез генов APC, CDH13, MLH1, MGMT, P16 и RASSF1A также подавляется в опухолях человека посредством метилирования их регуляторных областей, что может быть использовано для диагностики и определения прогноза развития рака.
Материал и методы. С помощью метода бисульфитного пиросеквенирования был определен уровень метилирования (Met, %) 65 CpG-сайтов промоторных участков шести генов (APC, CDH13, MLH1, MGMT, P16 и RASSF1A) в опухолях и условно нормальных тканях толстой кишки. В исследование вошли 50 пациентов (по 25 мужчин и женщин, медиана возраста – 60,5 лет), прооперированных в Ростовском научно-исследовательском онкологическом институте. Выборку гистологически подтвержденного CRC составили аденокарциномы G2–G3, из которых 15 опухолей классифицировали как T3N0M0, 35 случаев с метастазами различной локализации – T3-4N1-2M0-1.
Результаты. В образцах опухолей отмечено статистически достоверное повышение уровня метилирования промоторных участков APC, CDH13, MGMT, P16 и RASSF1A (в 3–5 раз при p < 0,01) в 36, 53, 38, 25 и 8% случаев соответственно. В целом, 35 образцов колоректальных неоплазий (70%) продемонстрировали CpG-гиперметилирование хотя бы по одному гену, 16 из них (45%) были гиперметилированы по трем-четырем генам. Определение ассоциаций возраста и пола пациентов с уровнем метилирования CpG-сайтов не выявил значимой корреляции, за исключением метилирования гена MGMT, уровень которого изменялся обратно пропорционально возрасту. Выявлена ассоциация статуса метилирования APC, CDH13, MGMT, P16 и RASSF1A с формированием метастазов (χ2 = 7,3, р = 0,007). В данном исследовании идентифицировано только два случая CpG-гиперметилирования (медиана Met = 42%) промотора MLH1.
Выводы. Полученные данные об увеличении метилирования промоторных участков пяти геновонкосупрессоров могут быть использованы в качестве чувствительных предиктивных маркеров прогрессии и метастазирования колоректального рака.
Водолажский Д.И., Тимошкина Н.Н.
