ИЗМЕНЕНИЕ ПРОТЕОМНОГО ПАТТЕРНА ПРИ КОЛОРЕКТАЛЬНОМ РАКЕ У ПАЦИЕНТОВ ЮГА РОССИИ
Введение. Колоректальный рак относится к наиболее распространенным типам неоплазий в развитых странах. За последние 20 лет, по данным мировой статистики, число летальных случаев от данной патологии в год увеличилось на 31%, что позволяет ей занимать второе место по показателю смертности среди всех онкологических заболеваний. Несмотря на обширные исследования по патогенезу колоректального рака на молекулярно-биологическом уровне, данных об эффективных белковых биомаркерах малигнизации при данной нозологии представлено немного.
Цель: проведение скринингового протеомного исследования для поиска новых информативных биомаркеров, которые затем могут быть эффективно использованы в рутинных гистохимических исследованиях.
Материал и методы. Для исследования использовали опухолевые и условно здоровые ткани (контроль) 20 пациентов Юга России с гистологически подтвержденным диагнозом «аденокарцинома толстой кишки». Экстракцию белков, маркировку и гибридизацию на слайде проводили с использованием набора Panorama Antibody Microarray – Cell Signaling Kit (Sigma, США) в соответствии с инструкцией производителя. Слайды сканировали на сканере для микрочипов GenePix 4100A (Molecular Devices, США). Биоинформационный анализ данных проводили с использованием программного обеспечения для анализа изображений GenePixTM Pro 6.0. Нормализацию данных проводили двумя методами: сменой красителя и по ре-
ференсным белкам.
Результаты. В смешанной выборке, состоящей из пациентов разного возраста и пола, обнаружено достоверное увеличение экспрессии четырех белков: NGFR p75 (Nerve Growth Factor Receptor), Phospho-Ta, FAK (Focal Adhesion Kinase) и PKC g. 10 пациентов выборки составили женщины в возрасте 43–81 год, у которых обнаружено увеличение экспрессии только Phospho-Ta и PKC g. У 10 пациентов-мужчин в возрасте 50–76 лет наблюдалось достоверное увеличение экспрессии пяти белков: c-myc, NGFR p75, FAK, PKC b,
Phospho-Pyk2. У пациентов обоих полов после 60 лет наблюдается достоверное увеличение экспрессии белков c-myc, Cytokeratin pep 4, Glutamate receptor NMDAR 2a, NGFR p75, PKC g и Phospho-Pyk2.
Выводы. В рамках данного исследования определена эффективная панель протеомных биомаркеров для диагностики колоректального рака, установлены возрастные и половые различия в изменении экспрессии белков у пациентов с этой патологией.
Кит О.И., Харин Л.В., Водолажский Д.И., Кутилин Д.С., Кожушко М.А.,
Золотухин П.В.
Введение. Колоректальный рак относится к наиболее распространенным типам неоплазий в развитых странах. За последние 20 лет, по данным мировой статистики, число летальных случаев от данной патологии в год увеличилось на 31%, что позволяет ей занимать второе место по показателю смертности среди всех онкологических заболеваний. Несмотря на обширные исследования по патогенезу колоректального рака на молекулярно-биологическом уровне, данных об эффективных белковых биомаркерах малигнизации при данной нозологии представлено немного.
Цель: проведение скринингового протеомного исследования для поиска новых информативных биомаркеров, которые затем могут быть эффективно использованы в рутинных гистохимических исследованиях.
Материал и методы. Для исследования использовали опухолевые и условно здоровые ткани (контроль) 20 пациентов Юга России с гистологически подтвержденным диагнозом «аденокарцинома толстой кишки». Экстракцию белков, маркировку и гибридизацию на слайде проводили с использованием набора Panorama Antibody Microarray – Cell Signaling Kit (Sigma, США) в соответствии с инструкцией производителя. Слайды сканировали на сканере для микрочипов GenePix 4100A (Molecular Devices, США). Биоинформационный анализ данных проводили с использованием программного обеспечения для анализа изображений GenePixTM Pro 6.0. Нормализацию данных проводили двумя методами: сменой красителя и по ре-
ференсным белкам.
Результаты. В смешанной выборке, состоящей из пациентов разного возраста и пола, обнаружено достоверное увеличение экспрессии четырех белков: NGFR p75 (Nerve Growth Factor Receptor), Phospho-Ta, FAK (Focal Adhesion Kinase) и PKC g. 10 пациентов выборки составили женщины в возрасте 43–81 год, у которых обнаружено увеличение экспрессии только Phospho-Ta и PKC g. У 10 пациентов-мужчин в возрасте 50–76 лет наблюдалось достоверное увеличение экспрессии пяти белков: c-myc, NGFR p75, FAK, PKC b,
Phospho-Pyk2. У пациентов обоих полов после 60 лет наблюдается достоверное увеличение экспрессии белков c-myc, Cytokeratin pep 4, Glutamate receptor NMDAR 2a, NGFR p75, PKC g и Phospho-Pyk2.
Выводы. В рамках данного исследования определена эффективная панель протеомных биомаркеров для диагностики колоректального рака, установлены возрастные и половые различия в изменении экспрессии белков у пациентов с этой патологией.
Кит О.И., Харин Л.В., Водолажский Д.И., Кутилин Д.С., Кожушко М.А.,
Золотухин П.В.
