ИЗМЕНЕНИЕ ПРОТЕОМНОГО ПАТТЕРНА ПРИ КОЛОРЕКТАЛЬНОМ РАКЕ У ПАЦИЕНТОВ ЮГА РОССИИ
Введение. Колоректальный рак относится к наиболее распространенным типам неоплазий в развитых странах. За последние 20 лет, по данным мировой статистики, число летальных случаев от данной патологии в год увеличилось на 31%, что позволяет ей занимать второе место по показателю смертности среди всех онкологических заболеваний. Несмотря на обширные исследования по патогенезу колоректального рака на молекулярно-биологическом уровне, данных об эффективных белковых биомаркерах малигнизации при данной нозологии представлено немного.
Цель: проведение скринингового протеомного исследования для поиска новых информативных биомаркеров, которые затем могут быть эффективно использованы в рутинных гистохимических исследованиях.
Материал и методы. Для исследования использовали опухолевые и условно здоровые ткани (контроль) 20 пациентов Юга России с гистологически подтвержденным диагнозом «аденокарцинома толстой кишки». Экстракцию белков, маркировку и гибридизацию на слайде проводили с использованием набора Panorama Antibody Microarray – Cell Signaling Kit (Sigma, США) в соответствии с инструкцией производителя. Слайды сканировали на сканере для микрочипов GenePix 4100A (Molecular Devices, США). Биоинформационный анализ данных проводили с использованием программного обеспечения для анализа изображений GenePixTM Pro 6.0. Нормализацию данных проводили двумя методами: сменой красителя и по ре-
ференсным белкам.
Введение. Колоректальный рак относится к наиболее распространенным типам неоплазий в развитых странах. За последние 20 лет, по данным мировой статистики, число летальных случаев от данной патологии в год увеличилось на 31%, что позволяет ей занимать второе место по показателю смертности среди всех онкологических заболеваний. Несмотря на обширные исследования по патогенезу колоректального рака на молекулярно-биологическом уровне, данных об эффективных белковых биомаркерах малигнизации при данной нозологии представлено немного.
Цель: проведение скринингового протеомного исследования для поиска новых информативных биомаркеров, которые затем могут быть эффективно использованы в рутинных гистохимических исследованиях.
Материал и методы. Для исследования использовали опухолевые и условно здоровые ткани (контроль) 20 пациентов Юга России с гистологически подтвержденным диагнозом «аденокарцинома толстой кишки». Экстракцию белков, маркировку и гибридизацию на слайде проводили с использованием набора Panorama Antibody Microarray – Cell Signaling Kit (Sigma, США) в соответствии с инструкцией производителя. Слайды сканировали на сканере для микрочипов GenePix 4100A (Molecular Devices, США). Биоинформационный анализ данных проводили с использованием программного обеспечения для анализа изображений GenePixTM Pro 6.0. Нормализацию данных проводили двумя методами: сменой красителя и по ре-
ференсным белкам.
