СРАВНЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ДВУХ МЕТОДОВ В ДИАГНОСТИКЕ
ИНФЕКЦИЙ МОЧЕВЫВОДЯЩИХ ПУТЕЙ У ОНКОЛОГИЧЕСКИХ БОЛЬНЫХ
Цель: сравнительная оценка эффективности ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) и культурального метода в диагностике инфекций мочевыводящих путей (ИМП) у онкологических больных.
Материал и методы. Исследовано 33 образца мочи. Один и тот же образец изучали с помощью культурального метода и ПЦР-РВ. При использовании культурального метода видовую принадлежность штаммов и чувствительность определяли с помощью автоматической системы VITEK 2 (bioMerieux, Франция). Для обнаружения ДНК Enterobacteriaceae spp., Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Enterococcus spp., Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli и грибов рода Candida (C. albicans,
C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis) использовали методики ЦНИИЭ. Все методики основаны на использовании мультиплексной ПЦР. Количество ДНК рассчитывали в геномных эквивалентах/мл (ГЭ/мл).
Результаты. Положительными по результатам культурального исследования оказалось 39,4% образцов мочи, по результатам ПЦР-РВ – 60,6%. Всего при микробиологическом исследовании мочи было изолировано 16 культур микроорганизмов из 13 образцов (39,4%), в ПЦР-РВ выявлена ДНК 28 микроорганизмов в 20 образцах (60,6%). При сопоставлении результатов исследования образцов мочи, полученных разными методами, из анализа были исключены образцы с количеством менее 103 ГЭ/мл. Полное совпадение результатов отмечено в 28 случаях (66,6%). В двух случаях в ПЦР-РВ был получен отрицательный результат при
положительных результатах посевов (E. faecalis 106 КОЕ/мл и E. coli 108 КОЕ/мл). В 12 случаях (28,6%) при отрицательных результатах посевов в ПЦР-РВ был обнаружен генетический материал возбудителей ИМП.
Уровень обсемененности при этом составил 103 ГЭ/мл (семь образцов), 104 ГЭ/мл (два образца), 105 ГЭ/ мл (два образца) и 107 ГЭ/мл (один образец). Дискордантные результаты можно объяснить как большей чувствительность метода, так и возможностью определения ДНК погибших микроорганизмов, так как многие пациенты на момент обследования получали антибактериальные препараты. В этиологической структуре ИМП у онкологических больных преобладали традиционные уропатогены: E. coli, Enterococcus spp., Kl. pneumoniae. Однако ранговые значения различных патогенов при исследовании культуральным и молекулярным методами отличались. При исследовании культуральным методом чаще других была обнаружена Kl. pneumoniae, затем Enterococcus spp. и E. coli. При исследовании методом ПЦР-РВ – E. coli, Kl. pneumoniae и Enterococcus spp. Моноинфекция была обнаружена в 10 случаях (76,9% от положительных образцов) при исследовании культуральным методом и в 12 случаях (60,0%) при исследовании методом ПЦР. Результаты исследований показали, что молекулярный метод детекции оказался более эффективным. В случаях развития ИМП при использовании ПЦР-РВ различные патогены в клинически значимом количестве были обнаружены в 2,15 раза чаще (28 патогенов против 13), чем при использовании культурального метода.
Выводы. Учитывая скорость развития инфекционного процесса у онкологических больных, исследования, проведенные с привлечением молекулярных методов, могут служить эффективным инструментом для своевременного выявления проблемных микроорганизмов, в том числе штаммов, несущих генетические детерминанты резистентности. Молекулярные методы позволяют быстро получить результат и могут быть рекомендованы в случаях необходимости принятия срочного решения о проведении или коррекции антибиотикотерапии с учетом данных локального микробиологического мониторинга.
Зыкова Т.А., Шевченко А.Н., Богомолова О.А., Хомутенко И.А., Панова Н.И.
